Clonal evolution

Get Started. It's Free
or sign up with your email address
Rocket clouds
Clonal evolution by Mind Map: Clonal evolution

1. COORTE

1.1. Selezione CAMPIONI VALIDI per QUALITA' ESPERIMENTI - SNP - Mutazioni

1.1.1. Selezione PAZIENTI VALIDI per qualità ACCOPPIAMENTO: - entrambe le fasi valutabili

2. "DATO_GENOMICO_pazienti_validi_CE_SP"

3. COPY NUMBER

3.1. segmenti Rawcopy

3.1.1. FOCAL

3.1.1.1. GISTIC

3.1.1.1.1. DEFINIZIONE: Pannello di geni focali nel MM

3.1.2. BROAD

3.1.2.1. PULIZIA SEGMENTI : - Focal cleaner (1 Mb)

3.1.2.1.1. PAREGGIO SEGMENTI: - Breakpoint detector - Legolizer

4. MUTAZIONI

4.1. Sophia PANEL

4.1.1. MUTECT pipeline

4.1.1.1. Trasformazione VAF in mutCN e CCF

4.1.1.1.1. MUTATION-virtual SKY

5. COMPLETE Virtual-SKY

6. Organizzazione files dati:

6.1. "Elenco_pazienti_reclutati_CE_SP"

6.1.1. "DATI_CAMPIONI_SOPHIAPANEL_validi_CE_SP"

6.1.2. "DATI_CAMPIONI_SNP_validi_CE_SP"

6.1.3. "DATO_CLINICO_pazienti_validi_CE_SP"

7. DATASET_CE_SP

8. REWIEW purezza