1. Stérile et absence de microbiote
2. Participation aux fonctions de protection de l'organisme
3. Biofilm: Protection contre l'agression de micro-organismes responsable d'infection diverses 3.L
4. Populations microbiennes
4.1. Microbiote buccal
4.1.1. Bouche
4.1.1.1. Candidose: Candida a. est inoffensive, à l'origine de Candidoses
4.1.1.1.1. Maladies avec taches blanches douloureuses sur la langue ou le palais
4.1.1.2. Champignon: Candida albicans est une levure (champignon microscopique) présent dans la bouche des êtres humains.
4.2. Microbiote intestinal
4.2.1. Tube digestif
4.3. Microbiote vaginal
4.3.1. Vagin
4.3.1.1. Lactobacillus: bactérie formant une barrière sous-forme de biofilm
4.3.1.1.1. Les chercheurs envisagent plusieurs pistes thérapeutiques
4.4. Préparation des aliments pour la digestion et l'évacuation des matières fécales
4.5. Microbiote cutanée
4.5.1. Peau
4.5.1.1. Virus de la Varicelle (haut) Staphylococcus epidermidis (bactérie)
4.5.1.2. Bactérie formant une barrière sur la peau
4.5.1.2.1. Protection contre les pathogènes invasifs
4.5.1.2.2. Elimination thérapeutique du microbiome cutanée (antibiotique, désinfection)
5. Microbiote du système digestif
5.1. Estomac
5.1.1. 10 à 1000 bactéries /ml
5.1.2. Milieu oxygéné et acide
5.2. Intestin grêle
5.2.1. 10 000 à 10 millions de bactéries /ml
5.2.2. Acidité et oxygène se raréfiant progressivement
5.3. Côlon
5.3.1. 10 milliards à 10 000 milliards de bactéries /ml
5.3.2. Milieu sans oxygène ni acidité
5.4. Micro-organismes vivants /ml (cfu/ml)
6. Rôles
6.1. Immunité
6.1.1. Participation à la fonction barrière de l'intestin en empêchant la colonisation par des espèces pathogènes
6.2. Digestion
6.2.1. Les micro-organismes assurent la fermentation des fibres alimentaires
6.2.1.1. constitué de bactéries appartenant au genre lactobacillus
6.2.1.1.1. Agit contre la colonisation du tube digestif par des pathogènes
7. Localisation des micro-organismes
7.1. Peau
7.2. Yeux
7.3. Organes génitaux
7.4. Intestin grêle
7.5. Ecosystèmes pour Intestin grêle et Côlon
7.5.1. Altéré par la prise d'antibiotiques
7.5.2. Par un bain de bouche antibactérien, par des savons
7.6. Côlon
8. Perturbation et Conséquence
8.1. Maladies associées à un déséquilibre du microbiote
8.1.1. Maladie de Crohn
8.1.2. Diabète de type 1
9. Utilisation thérapeutique
9.1. Les bactéries de la flore intestinale
10. Diversité bactérienne
10.1. Bactéroidetes
10.1.1. Bactéroides
10.1.2. Protovella
10.2. Proteobactéries
10.2.1. Escherichia coli
10.3. Firmicutes
10.3.1. Entérocoques
10.3.2. Streptocoques
10.3.3. Clostridium
10.3.4. Tactobacilles
10.4. Actinobacteria
10.4.1. Bifidobactéries
11. Composition de microbiote
11.1. Jeune enfant
11.1.1. Type digestif
11.1.1.1. Diversification, contact, maladies, traitements...
11.2. Bébe
11.2.1. Tube digestif
11.2.1.1. Bactéries dans le lait
11.3. Contact avec le microbiote cutané de la mère
11.4. Nouveau-né
11.4.1. Tube digestif
11.4.1.1. Contact avec le microbiote maternel (vaginal/intestinal)
11.4.1.2. Accouchement par voie basse
11.5. Foetus
11.5.1. Tube digestif