1. 【専属パイロット】鈴原トウジ（旧作）/式波・アスカ・ラングレー（新劇場版）
1.1. 殲滅作戦により破壊
2. 【専属パイロット】ダミーシステム
2.1. アダムがベース。S2機関が暴走し、アメリカのネルフ支部もろとも消滅
3. A、B、Cの三つのコード（形態）を持つ。
3.1. 【コード4A】2つのコアを供えた円盤状。宇宙空間で改2号機を攻撃。一体ではなく複数存在していたが、8号機との連携ですべて殲滅された。
3.2. 【コード4B】宇宙空間で改2号機を攻撃。A.T.フィールドで中和できない光を放つ。アスカのシンジに対する呼びかけでわずかに反応、覚醒した初号機の発した光で殲滅。
3.3. 【コード4C】ヴンダー襲撃時に現れた。触れた物を消滅させる光で複数の柱を作り、その感覚を縮めることでヴィレ側に打撃を与えようとするが、ヴンダーの主機が起動し、16個のコアを破壊される。この際、使徒殲滅時と同じく虹がかかった。
4. 人類補完計画
4.1. LCLはリリスの血液
4.2. 不完全な生命体を完全な生命体に進化させること
4.3. カヲル目線
4.3.1. プログラムされていた絶滅行動
4.3.2. セリフ：この星で大量絶滅は珍しい事じゃない、むしろ進化を促す面もある。 生命とは本来 世界に合わせて自らを変えていく存在だからね。 しかし リリンは自らではなく世界のほうを変えていく。 だから 自らを人工的に進化させるための儀式を起こした。 古の生命体をニエとし 生命の実を与えた新たな生命体を作り出すためにね。 全てが太古よりプログラムされていた絶滅行動だ。 ネルフでは人類補完計画と呼んでいたよ。
4.4. ゼーレ目線
4.4.1. カヲル君の必要性
4.4.1.1. カヲル君をシンジに殺させることで 初号機のパイロットを精神的に追い込み、 サード・インパクトでシンジが《神》になったとしても、 彼が絶望感のままに自分も他人もヒトもシトも区別のない世界（ゼーレの望む世界）を望むよう、仕向けた
4.5. ゲンドウ目線
4.5.1. ユイと再会することを一番の目標
4.5.2. 〈第13号機〉の覚醒
4.5.2.1. 神と同等の存在へとなること アダムとリリスのクローンであるレイを使った禁断の融合をする 生命の源であるアダムとリリスの融合により、生命の実と知恵の実両方を手に入れた存在、神となること。 アダムとリリスを融合したあと覚醒した初号機を取り込むことでコアに眠るユイと再会できる。
4.5.2.2. 人が持つ知恵の実と使徒が持つ生命の実を融合させることにより、 完全なる単一生命体になることを目指した。 使徒が持っているのは永遠に生きられる生命の実で 人類が持っている知恵の実だけでは永遠に生きることが出来ない。 知恵の実を持つヒトに使徒が持つ命の実を与え、 人類が個を捨てひとつになり、 知恵を持ったまま永遠の命を得ることが目的だった。
4.5.2.2.1. 『人類補完計画』も全ての魂を一つにしてこのガフの部屋へ還ることがこの計画の目的になっています。
5. 機体
5.1. 初号機
5.1.1. 擬似シン化第1覚醒形態
5.1.1.1. 序：ゼルエルを捕食した。これにより、初号機にS2機関が取り込まれた
5.1.2. 擬似シン化第2形態
5.2. 零号機
5.3. 弐号機
5.3.1. 獣化第2形態（第1種）
5.3.1.1. 破
5.3.1.1.1. マリにより裏コードで発動。
5.3.2. 改2号機β
5.3.2.1. Q
5.3.2.1.1. Mark.4（4a）による攻撃で中破し、そのまま大気圏突入
5.3.3. 改2号機γ
5.3.3.1. Q
5.3.3.1.1. 暴走したMark.09や第13号機と戦うが、Mark.09殲滅のため自爆。
5.3.4. 獣化第4形態（第2種）
5.3.4.1. Q
5.3.4.1.1. コード777（トリプルセブン）で発動。Mark.09との対戦中
5.3.5. 特務機関NERVユーロ支部→特務機関NERV日本本部（『破』）→ヴィレ（『Q』）
5.4. 3号機
5.4.1. 特務機関NERV北米第3支部→特務機関NERV日本本部
5.5. 4号機
5.5.1. 特務機関NERV北米第2支部
5.6. 量産機エヴァシリーズ（5号機～13号機）
5.6.1. ダミーシステム
5.6.2. S2機関を搭載、渚カヲルの思考パターンがベースとなるダミーシステムを使用
5.7. Mark.04
5.7.1. 【専属パイロット】不明
5.8. 仮設5号機
5.8.1. 【専属パイロット】真希波・マリ・イラストリアス
5.8.1.1. 第3の使徒と交戦する。あり合わせで作成されている肩の先にあるパンタグラフが電力供給源。使徒をケイロンエリアにまで侵入させるも、コアを握りつぶし、自爆で使徒を殲滅した。
5.9. Mark.06
5.9.1. 【専属パイロット】渚カヲル
5.9.1.1. 序・破6号機・QMark.06
5.10. 8号機
5.10.1. 【専属パイロット】真希波・マリ・イラストリアス
5.10.2. ネルフにあったが、強奪によりヴィレ所属
5.11. Mark.09（もしくはアダムスの器）
5.11.1. 【専属パイロット】アヤナミレイ
5.11.1.1. Q
5.11.2. ネルフ所属
5.11.3. アダムスの器＝第13号機が覚醒したことで、自律行動を始めた状態
5.12. 第13号機
5.12.1. 第13号機 疑似シン化第3+形態(推定)
5.12.1.1. 【専属パイロット】碇シンジ及び渚カヲル
5.12.1.2. 使徒の持つS2機関は、 永久の動力をもたらすと同時に、 細胞再生系細胞群の自死機構を制御しているとも考えられる。 つまり、自ら死に、新しい生命体へと進化することができるのである。
6. ヴィレ
6.1. ヴンダー
6.1.1. 衛星軌道上から回収したEVA初号機を主器動力 ATフィールドを発生させる 強力な重力制御システム
6.2. 神殺し
7. カヲルくん
7.1. セリフ
7.1.1. 生と死は等価値なんだよ
7.1.1.1. カヲルには生き延びたいという概念なし 使徒である彼は永久に生き続けるから 自我しか持たない他の使徒と違い、 人の脳を持つカヲルは自らを省みることが可能 命が永遠である代わりに、繁殖も生産的活動もしない。 生きていても何にもならない。 だから死んでいるのと変わらず彼にとって「生と死は等価値」
7.2. 第1使徒「アダム」の魂を持った存在
7.2.1. 新劇場版では月面の棺から目覚めるという意味深な登場
7.3. DSSチョーカー
7.3.1. 自分の首に付けたときには、なにも反応していない。 「第１使徒」というのであれば、 このときに〈使徒〉と識別されてもよさそうだが、 実際はそうなっていない。
7.3.2. マリの言うところの「ゲンドウ君の狙い」とは、 カヲルをあらためて殲滅対象としての〈使徒〉にする、 というものだったのだ。
8. Q
8.1. 謎
8.1.1. リリン(人類)が入れない結界の中に、アスカ、シンジ、アヤナミ(仮称)がいる
9. 「新劇場版：序」の発表時、庵野監督 『「エヴァ」は繰り返しの物語です。 主人公が何度も同じ目に遭いながら、 ひたすら立ち上がっていく物語です。 わずかでも前に進もうとする、意志の話です。』
10. 主題歌オススメ曲
10.1. 序
10.1.1. Beautiful World
10.2. 破
10.2.1. Beautiful World -PLANiTb Acoustica Mix-
10.2.1.1. 今日の日はさようなら
10.3. Q
10.3.1. 桜流し
10.4. 新世紀エヴァンゲリオン劇場版 Air/まごころを、君に
10.4.1. THANATOS -IF I CAN'T BE YOURS-
10.5. 第22話「せめて、人間らしく」
10.5.1. メサイア』より「Hallelujah」
10.6. 第24話「最後のシ者」
10.6.1. ベートーヴェン交響曲第9番第4楽章「歓喜の歌」
10.7. 宇多田ヒカル
10.7.1. One Last Kiss
11. 序
11.1. あらすじ
11.2. 序 新旧の違い
11.2.1. 年代
11.2.1.1. 旧：西暦2015年
11.2.1.2. 新：劇中の年号表記が意図的に消されている。理由は不明。
11.2.2. 「赤い海」と「青い海」
11.2.2.1. 旧：地球の海の色が「青い海」から「赤い海」に変わる(物語終盤に)
11.2.2.2. 新：物語冒頭から海の色が赤い(※15年前のセカンドインパクトが原因とされる)
11.2.3. 「第2の使徒 リリス」の仮面が変更された
11.2.3.1. 旧作：ゼーレの仮面をつけている
11.2.3.2. 新劇場版：使徒と同じ顔の仮面をつけている
11.2.4. 渚カヲルが目覚めた場所に、ネルフ基地(タブハベース)が存在する。 発掘現場の巨人にはゼーレマークの仮面がつけられている。後に「EVANGELION：Mark.06」として登場する。
11.3. 謎のセリフ
11.3.1. 「また３番目とはね、変わらないな君は、会える時が楽しみだよ。碇シンジ君」
11.3.1.1. 月面には棺の数も９つあります。その５つ目の棺から登場しています。 これは、カヲルの月での再生が５回目ということを表しています。 おそらく、地球上の人類にとっても５回目の再生であり、シンジにとっても５回目の再生なのです。 そして、そのすべてにおいておそらくシンジは常にサードチルドレンの位置を繰り返しており、これは、業のようなものと考えています。 この無限ループのような世界から抜け出すことがおそらく人類補完計画の一部ではないか
12. 破
12.1. 「序」はセカンドインパクト後の世界
12.2. セカンドインパクトにより再生（書き換え）されたのちの世界が「序」
12.3. 劇中の舞台が何年か分からなくなっている
13. ワード関係
13.1. S2機関
13.1.1. 量産機エヴァシリーズ（5号機～13号機）
13.2. バラルの扉
13.2.1. 初号機由来
13.2.2. バラルとは旧約聖書に記載されているバベルの塔に由来
13.2.3. 神（アダム、リリス）をマネて作られてエヴァによって『バレルの扉』を開くことが、ゼーレとネルフの目的
13.3. 赤い海
13.3.1. 触れたものすべてをコア化させる
13.3.1.1. コア化が進行した部分はやがて爆発して消滅
13.3.2. Ｌ結界
13.3.2.1. リリンのＬ
13.3.3. 浸食濃度を「Ｌ結界濃度」
13.4. 月
13.4.1. 黒き月
13.4.1.1. ジャイアントインパクト
13.4.1.1.1. ＝ファーストインパクト
13.4.1.2. 第2使徒『リリス』
13.4.1.2.1. リリスとＬＣＬが入っていた
13.4.1.2.2. アダムが眠った後リリスは人類を生み出し、世界に人類が繁栄
13.4.1.2.3. アダムを含む使徒は眠りにつき、月が誕生
13.4.2. 白き月
13.4.2.1. 最初に落ちた
13.4.2.2. 第1使徒『アダム』
13.4.2.2.1. 『アダム』裏死海文書ロンギヌスの槍が南極に大陸に落下
13.4.2.2.2. 地上の支配者になるべく使徒を生み出した
13.5. ガフの扉
13.5.1. ガフの部屋は魂が集まる場所として存在しているため、生まれてくる魂も還る魂もここに集まります。つまりガフの扉が開くとはこのガフの部屋が魂を受け入れる状態（インパクト）になったことを指します。
13.5.2. アダムとリリス由来
13.5.3. アダムとリリス（神々）の持つ『ガフの扉』
13.6. ターミナルドグマ
13.6.1. 第1使徒アダムが幽閉されている、 とされるジオフロントの最深部。 使徒に侵入された場合に備え、 自爆装置が設置されている。 もっとも実際に磔にされているのはアダムではなく第2使徒リリス
14. 謎
14.1. エヴァには搭乗者の願いや意志を読みとる機能がある？
14.1.1. 〈アダムス〉に装甲を付けたゼーレ型
14.1.2. 乗る者の意志で動かせるネルフ型
14.2. エヴァでよく出る魂とは
14.2.1. 〈魂〉とは人の願いや想いのこと
14.2.2. セリフ：いや リリンの模造品では無理だ 魂の場所が違うからね
14.2.2.1. カヲルは、槍で世界を修復したい（させてあげたい）という強い想いがある。 シンジも同様だ。しかし、 アヤナミレイは「槍を抜く」と考えたとしても、 それは命令だからで、強い意志によるものではない。（Qの中のレイ）