1.1. Las moléculas son más inmunogénicas cuanto mayor es la distancia filogenética entre el antígeno y el individuo.
2. Tamaño molecular
2.1. Hay mayor inmunogenicidad a mayor tamaño, usualmente a partir de 100 kDa. Menos de 10 kDa resulta en menor inmunogenicidad.
3. Composición y complejidad química
3.1. Estructuras complejas (aminoácidos aromáticos, heteropolímeros, proteínas con conformación terciaria o cuaternaria, moléculas conjugadas) suelen ser más inmunogénicas.
4. Susceptibilidad al procesamiento y la presentación de antigeno
4.1. Antígenos grandes, insolubles y proteínas formadas por L-aminoácidos son más fácilmente fagocitados y procesados por una célula presentadora de antígenos, por lo tanto, son más inmunogénicos.
