1. Representación de la estereoquímica de las moléculas.
1.1. Representación proyectiva (CRAM).
1.2. Representación en perspectiva.
1.3. Representación de Newman.
1.4. Representación de Fischer.
1.4.1. Cada carbono tetraédrico, se representa como una cruz, en donde las líneas horizontales se dirigen hacia afuera del papel y las verticales hacia adentro.
1.5. Representación de Harwoth.
1.5.1. Representación en perspectiva de formas cíclicas de moléculas de azúcar.
2. Quiralidad.
2.1. Toda figura geométrica cuya imagen en un espejo plano, idealmente realizada, no puede hacerse coincidir.
2.1.1. Una molécula quiral existe en dos foras estereoisómericas: enantiómeros.
2.1.1.1. Objetos no superponibles con sus imágenes especulares.
2.1.1.1.1. Centros asimétricos
2.1.1.1.2. Estereocentro
2.1.1.2. Isomería óptica.
2.1.1.2.1. Las actividad óptica de las parejas de enantiómeros es la propiedad característica para diferenciarlos.
2.1.1.2.2. Las propiedades físicas de enantiómeros son idénticas si tienen los mismos puntos de ebullición y fusión.
2.1.1.2.3. Si ni es ópticamente activa, no se observa cambio de la vibración en Luz polarizada.
2.1.1.2.4. Configuración absoluta de un átomo de carbono asimétrico.
3. Relación estructura actividad.
3.1. La afinidad de un fármaco por un componente macromolecular específico de la célula (receptor) y su actividad intrínseca, tiene una relación con su estructura química.
3.1.1. Mezcla Racémica de enantiómeros.
3.1.1.1. Caso I.
3.1.1.1.1. Uno de los enantiómeros es inactivo dentro de la mezcla racemica.
3.1.1.2. Caso II.
3.1.1.2.1. Un enantiómero presenta actividad terapéutica favorable, mientras que su contraparte presenta efectos secundarios perjudiciales.
3.1.1.3. Caso III.
3.1.1.3.1. Ambos enantiómeros poseen beneficios.
4. Estructura química de los fármacos y actividad biológica.
4.1. Aunque sólo una parte de la molécula puede asociarse con la actividad, pueden hacerse un gran número de modificaciones químicas.
4.2. La relación cuantitativa estructura-actividad (QSAR, QSPR), es el proceso por el cual la estructura química se correlaciona cuantitativamente con un proceso definido.
4.2.1. Actividad=f(propiedades fisicoquímicas y/o propiedades estructurales).
5. Teoría de receptores
5.1. Afinidad por el fármaco con el que se fija, aún en concentración pequeña.
5.2. La especificidad gracias a la cual puede distinguir una molécula aunque sean muy parecidas.
5.3. Enlaces iónicos; Puentes de Hidrógeno; Interacciones hidrofóbicas; uniones covalentes.
5.3.1. Generalmente reversibles.
6. Receptores farmacológicos
6.1. Receptores con actividad enzimática (Tirosina Cinasa).
6.1.1. Receptores Proteíncinasa.
6.1.1.1. Proteíncinasas ligadas a membranas plasmáticas que fosforilan proteínas blanco.
6.1.1.2. Fosforila resíduos de tirosina, serina o treonina específos.
6.2. Receptores tipo canales iónicos.
6.2.1. Regulados por agonistas/antagonistas
6.2.2. Selectividad iónica en la membrana plasmática.
6.2.3. Son proteínas con múltiples subunidades transmembrana.
6.2.3.1. R. Nicotínico de acetilcolina
6.2.3.2. R. GABA.
6.2.3.3. R. de glicina.
6.3. Receptores acoplados a proteína G.
6.3.1. De membrana que interactúan con proteínas efectoras intracelulares (Proteína G).
6.3.1.1. Receptor: Proteína hidrófoba con 7 elementos helicoidales transmembrana.
6.3.1.2. Proteína G
6.3.1.2.1. Moléculas heterodiméricas alfa, beta y gama.
6.4. Receptores citosólicos o intracelulares.
6.4.1. Factores de transcripción
6.4.2. Receptores de hormonas esteroideas.
6.4.3. Proteínas ligadoras de DNA que regulan la transcripción de genes específicos.
6.4.4. 3 dominios funcionales.
6.4.4.1. Ligador de hormona
6.4.4.2. Unión a sitios específicos del DNA.
6.4.4.3. Dominio función desconocida.
6.5. Función de los rectores.
6.5.1. Modificaciones iónicas.
6.5.2. Modificaciones de la actividad de múltiples enzimas.
6.5.3. Modificaciones en la estructura de proteínas que dan origen a cambios estucturales de la célula.
7. Relación dosis-respuesta.
7.1. Potencia o concentración de dosis efectiva.
7.1.1. Cantidad de fármaco que se requiere para inducir una reacción determinada.
7.1.1.1. DE50 (Dosis efectiva 50)
7.2. Actividad máxima
7.2.1. Reacción máxima que produce un agente.
7.2.2. Depende del número de complejos F-R.
8. Isómeros.
8.1. La misma fórmula molecular, pero diferentes estructuras.
8.1.1. Isómeros constitucional o estructural.
8.1.2. Estereoisómeros.
9. Estereoquímica.
9.1. Rama de la química que estudia la disposición espacial de los átomos de una molécula.
9.2. Estudio de los isómeros
10. Isomería estructural.
10.1. Difieren en el orden en el que se enlazan los átomos en la molécula.
10.1.1. Isomería de cadena
10.1.1.1. Isómeros que tienen distribuidos los átomos de carbono de la molécula de forma diferente.
10.1.2. Isomería de posición.
10.1.2.1. Isómeros estructurales con mismo grupo funcional, pero enlazados a átomos de carbono con diferentes localizadores.
10.1.3. Isómeros de función.
10.1.3.1. Isómeros estructurales con diferente grupo funcional.
10.1.4. Tautomería.
10.1.4.1. Isómeros constitucionales de fácil interconversión por su rápido equilibrio. Un átomo de hidrógeno, situado en una triada de átomos y doble enlace cambian de posición simultáneamente.
11. Estereoisómeros.
11.1. Conformacionales
11.1.1. Modifican su orientación espacial, donde se convierten en otro isómero de la misma molécula, por rotación en torno a enlace simples:
11.1.1.1. Anti
11.1.1.2. Eclipsada
11.1.1.3. Alternada
11.2. Configuracionales
11.2.1. Misma forma estructural y diferente arreglo de sus átomos en el espacio. Son estructuralmente estables.
11.2.1.1. Geométricos.
11.2.1.1.1. Dos carbonos unidos con doble enlace que tienen las otras valencias con los mismos sustituyentes o con 2 iguales y uno distinto.
11.2.1.2. Ópticos
11.2.1.2.1. Originados por la distinta orientación espacial entorno a un estereocentro (con hibridación sp3 unido a 4 sustituyentes distintos.
12. Isomería geométrica.
12.1. El doble enlace no permite la libre rotación, generando dos estructuras distintas.
12.1.1. Isomería en alquenos. Debe cumplirse la rotación impedida y los dos grupos diferentes que deben estar unidos a ambos lados: cis y trans.
12.1.1.1. Efecto de la isomería geométrica sobre las propiedades físicas
12.1.1.1.1. Punto de fusión y ebullición.
12.1.1.2. Nomenlatura.
12.1.1.2.1. El modo general para describir a los alquenos consiste en E y Z.