1. • Secretário Executivo da Pesca
2. • Secretário Executivo do Desenvolvimento Agrário
3. • Secretário Executivo de Planejamento e Gestão Interna
3.1. Coordenadoria de Desenvolvimento da Agricultura Familiar
3.1.1. Célula de Desenvolvimento da Agricultura de Sequeiro
3.1.1.1. Núcleo das Culturas Alimentares*
3.1.1.2. Núcleo das Culturas Agroindustriais e Oleaginosas*
3.1.2. Célula do Desenvolvimento de Irrigação e Energias Renováveis da Agricultura
3.1.2.1. Núcleo de Fruticultura
3.1.3. Núcleo da Classificação Vegetal e Biotecnologia
3.1.4. Núcleo da Inovação Tecnológica, Mecanização e Conservação da Água e Solo
3.2. Coordenadoria do Desenvolvimento das Cadeias Produtivas da Pecuária
3.2.1. Célula do Desenvolvimento da Bovinocultura e Ovino-caprinocultura
3.2.1.1. Núcleo da Bovinocultura
3.2.1.2. Núcleo da Ovino-caprinocultura
3.2.2. Célula do Desenvolvimento da Suinocultura, Avicultura e Apicultura
3.2.2.1. Núcleo da Suinocultura e Avicultura
3.2.2.2. Núcleo da Apicultura
3.2.3. Núcleo das Energias Renováveis da Pecuária
3.3. Coordenadoria do Desenvolvimento Territorial Cooperativismo, Comercialização e Economia Solidária
3.3.1. Célula do Desenvolvimento Territorial
3.3.2. Célula do Cooperativismo, Comercialização e Economia Solidária
3.3.3. Núcleo da Aquisição de Alimentos
3.4. Coordenadoria do Desenvolvimento dos Assentamentos e Reassentamentos, Povos e Comunidades Tradicionais
3.4.1. Núcleo dos Assentamentos e Reassentamentos Rurais
3.4.2. Núcleo dos Povos Originários e Comunidades Tradicionais
3.5. Coordenadoria do Abastecimento de Água e Esgotamento Sanitário Rural
3.5.1. Célula do Abastecimento de água e Esgotamento Sanitário Rural
3.5.1.1. Núcleo da Engenharia e Acompanhamento de Obras
3.5.2. Núcleo das Tecnologias Sociais e Alternativas de Acesso à Água
3.6. Coordenadoria do Crédito Rural
3.6.1. Célula Operacional do Crédito Rural
3.6.2. Núcleo do Crédito Fundiário e Seguridade
3.6.3. Núcleo da Habitação Rural
3.7. Coordenadoria de Desenvolvimento da Pesca e Aquicultura Familiar
3.7.1. Célula de Apoio a Pesca e Aquicultura Familiar
3.7.2. Célula de Assistência Técnica e Extensão Pesqueira e Aquícola
3.7.3. Célula de Registro e Fiscalização
3.8. Coordenadoria Administrativo-Financeira
3.8.1. Célula de Gestão Financeira
3.8.1.1. Núcleo de Execução Orçamentária – Financeira
3.8.2. Célula de Gestão de Pessoas
3.8.2.1. Núcleo de Registros Funcionais
3.8.3. Célula de Patrimônio e Logística
3.8.4. Célula de Acompanhamento de Contratos, Convênios e Congêneres
3.8.4.1. Núcleo de Prestação de Contas
3.8.4.2. Núcleo de Apoio a Licitação
3.9. Coordenadoria do Desenvolvimento Institucional e Planejamento
3.9.1. Célula do Desenvolvimento Institucional
3.9.2. Célula do Planejamento