1. Isoetaceae
1.1. Cosmopolitas 1 genero
1.1.1. Características: Plantas aquáticas ou terrestres (ambientes úmidos); Caule do tipo cormo, globoso ou alongado e ereto; Microfilos lineares e ocos, geralmente maiores que 2cm; Esporângios não formam estróbilos; Plantas heterosporadas (micrósporos monoletes e megásporos triletes);
1.1.2. Parentes vivos mais próximos do clado das licófitas arbóreas do carbonífero
2. Selaginellaceae
2.1. Regiões trópicas 1 genero
2.1.1. Características: Plantas terrestres ou rupícolas; Microfilos espiralados; Esporângios dispostos nas axilas Plantas heterosporadas; (micrósporos e megásporos)
3. Plantas com raízes, caule e folhas (microfilos com nervuras)
3.1. Homosporadas: Lycopodiaceae Heterosporadas: Selaginellaceae e Isoetaceae
4. Lycopodiaceae
4.1. Cosmopolitas 4 generos
4.1.1. Características: Terrestres ou epífitas; Microfilos espiralados; Esporângios axilares, às vezes formando estróbilos no ápice dos ramos; Plantas homosporadas; Esporos triletes.