AULA 9 e 10

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AULA 9 e 10 por Mind Map: AULA 9 e 10

1. Método de Neighbor joiningituição

1.1. A partir da distancia entre os diversos pontos (genes ou proteínas) de uma árvore filogenética são buscados vizinhos

2. Modelos de substituição

2.1. Felsan 81

2.1.1. A≠T≠C≠G

2.1.2. β < α

2.1.3. β = Taxa de troca de purina por pirimidina

2.1.4. α = Taxa d troca entre purina ou entre pirimidinas

2.1.5. Como o programa entende que troca entre purinas ou entre pirimidinas é mais frequente e ocorre mais reparo, logo α está mais presente

2.2. HKY

2.2.1. Contempla a mencionada taxa entre transições e transversões, bem como leva em consideração a frequência de ocorrência de cada uma das bases nas sequências.

3. Qual modelo usar?

3.1. Fazer varredura de qual modelo lê melhor sua sequência

4. Número de árvores