Геном AZOTOBACTER

Начать. Это бесплатно
или Регистрация c помощью Вашего email-адреса
Rocket clouds
Геном AZOTOBACTER создатель Mind Map: Геном AZOTOBACTER

1. Биосинтетическая и метаболическая активность

1.1. treA

1.1.1. Моно-, ди- и трисахариды

1.2. sacB

1.2.1. Левансахаза

1.3. sacC

1.3.1. Эндолеваназа

1.4. agaA

1.4.1. β-агаразу

1.5. glcDEFG

1.5.1. Гликолатоксидаза

1.6. ttdAB

1.6.1. Тартат-дегидратазы

1.7. glcA

1.7.1. Гликолят

1.8. lctP

1.8.1. Лактат-пермеаза

1.9. tcuAB

1.9.1. Трикарбаллатат

1.10. benABCD

1.10.1. Бензоат

1.11. mhpD

1.11.1. Бензоат

1.12. xylJI

1.12.1. Бензоат

1.13. dmpI

1.13.1. Бензоат

1.14. xylEJK

1.14.1. Бензоат

1.15. pcaGH

1.15.1. Гидроксибензоат

1.16. pcaBCDF

1.16.1. Гидроксибензоат

1.17. fadA

1.17.1. Гидроксибензоат

1.18. mhpB

1.18.1. Фенилпропионат

1.19. ORF1,2

1.19.1. Фенилпропионат

1.20. mphCRDFET

1.20.1. Фенилпропионат

2. Основные биосинтетические и энергетические возможности

2.1. coo

2.1.1. Белок cooF

2.1.2. Белок S

2.1.3. Белок C

2.1.4. Белок T

2.1.5. Белок J

2.1.6. Белок ORF

2.1.7. CO-дегидрогеназа

2.2. cooA

2.2.1. Регулятор CO

2.3. fdhDGHIE

2.3.1. Формиатдегидрогеназа

2.4. Компоненты дыхательной цепи

2.4.1. nuoABCEFGHIJKLMN

2.4.1.1. NADH-хинон оксидоредуктаза 13

2.4.2. sdhCDCB, sucAB, lpdA, sucC

2.4.2.1. Сукцинат

2.4.2.2. Фумаратредуктаза

2.4.3. petA, petB, petC

2.4.3.1. Убихинолцитохром

2.4.3.2. Редуктаза

2.4.4. hup/hox

2.4.4.1. Комплекс убихинон-оксидоредуктазы

2.4.5. hypABFCDE Ni

2.4.5.1. Ассимиляция Ni

2.4.6. CytOx-1, CytOx-2, CytOx-3

2.4.6.1. Цитохром оксидаза

2.4.6.2. Хинол-терминальная оксидаза

2.4.7. cydAB

2.4.7.1. Хинол-окисляющий цитохром

3. N2-фиксация

3.1. nif

3.1.1. Кластер 1

3.1.1.1. nifHDK

3.1.1.1.1. Fe-белок

3.1.1.1.2. МoFe-белок

3.1.1.2. FeMo-co

3.1.2. Кластер 2

3.1.2.1. nifA L

3.1.2.2. nifB

3.1.2.2.1. Синтез Fe-ко-фактора

3.1.2.3. nifQ

3.1.2.3.1. Синтез Fe-ко-фактора

3.1.3. Кластер 3

3.1.3.1. rnfA1-H1

3.1.3.1.1. Одна из двух Na + -зависимых NADH-убихинонредуктаз

3.1.3.1.2. Fe-Mo-co NafY

3.1.3.2. modE

3.1.3.2.1. Гомеостаза Mo-процессинга

3.1.3.3. modG

3.1.3.3.1. Гомеостаза Mo-процессинга

3.1.3.4. modA1B1C1

3.1.3.4.1. ABC-транспортер

3.1.4. Кластер 4

3.1.4.1. rnfA1

3.1.4.1.1. Потенциальная система секреции

3.2. AcP

3.2.1. 2Fe-2S ферредоксин

3.3. vnf

3.3.1. Кластер 1

3.3.1.1. vnfH-

3.3.1.1.1. Fe-белок

3.3.1.2. vnfDGK

3.3.1.2.1. VFe. -протеин

3.3.2. Кластер 2

3.3.2.1. vnfDGK

3.3.2.1.1. белок VnfX

3.3.2.1.2. Пенреносчик фосфонат ABC

3.3.2.1.3. Пенреносчик фосфит ABC

3.3.3. Кластер 3

3.3.3.1. NifA

3.3.3.2. VnfA

3.3.3.3. AnfA

4. Иммунитет и устойчивость

4.1. CRISPR/CAS/CSE кластер

4.1.1. Иммунитет к поступающим нуклеиновым кислотам

4.1.2. CRISPR 1

4.1.2.1. Спейсеры от фрагментов поступающих вирусных или других мобильных генетических элементов.

4.1.3. CRISPR 2

4.1.3.1. Кодирует белки с самой высокой последовательностью

4.1.4. CAS

4.1.4.1. Кодирует белки с самой высокой последовательностью

4.1.5. CSE

4.1.5.1. Кодирует белки с самой высокой последовательностью

4.2. Системы ограничения и модификации

4.2.1. AchI

4.2.2. AchII

4.2.3. AchIII

4.2.4. AchIV

4.2.5. AchV

4.3. Поверхность клетки и выделенные полимеры

4.3.1. alg

4.3.1.1. algD

4.3.1.1.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.2. alg8

4.3.1.2.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.3. alg44

4.3.1.3.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.4. algK

4.3.1.4.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.5. algE

4.3.1.5.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.6. algG

4.3.1.6.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.7. algX

4.3.1.7.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.8. algL

4.3.1.8.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.9. algI

4.3.1.9.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.10. algF

4.3.1.10.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.11. algA

4.3.1.11.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.12. algC

4.3.1.12.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.13. algF

4.3.1.13.1. Биосинтез альгинатов

4.3.1.14. algR

4.3.1.14.1. Регуляция

4.3.1.15. algU

4.3.1.15.1. Регуляция

4.4. Капсульные липополисахариды

4.4.1. LPS Locus

4.4.1.1. lptCAD

4.4.1.1.1. Перенос O-антигена-липида A на внешнюю мембрану

4.4.1.2. lptD

4.4.1.2.1. Транспорт O-антиген-липид A к наружной мембране

4.4.1.3. surA

4.4.1.3.1. Сворачивание экстрацитоплазматических белков