1. Gram (+)
1.1. Cocci
1.1.1. Catalase (+)
1.1.1.1. Staphylococci
1.1.1.1.1. Coagulase (+)
1.1.1.1.2. Coagulase (-)
1.1.2. Catalase (-)
1.1.2.1. Beta
1.1.2.1.1. Bacitracin sensitive
1.1.2.1.2. Bacitracin resistant
1.1.2.2. Alpha
1.1.2.2.1. Optochin (P) disc sensitive
1.1.2.2.2. Optochin (P) resistant
1.2. Bacilli
1.2.1. Aerobic/facultative
1.2.1.1. Bacillus
1.2.1.1.1. B. anthracis
1.2.1.1.2. B. cereus
1.2.1.2. Listeria monocytogenes
1.2.1.3. Corynebacterium diphtheriae
1.2.1.4. Nocardia
1.2.2. Anaerobic
1.2.2.1. Clostridioides
1.2.2.1.1. C. difficle
1.2.2.1.2. C. botulinum
1.2.2.1.3. C. perfringens
1.2.2.1.4. C. tetani
1.2.2.2. Actinomyces
2. Gram (-)
2.1. Cocci
2.1.1. Aerobic
2.1.1.1. Neisseria
2.1.1.1.1. N. gonorrhoeae
2.1.1.1.2. N. meningitidis
2.2. Coccobacilli
2.2.1. Hemophilus influenzae
2.2.2. Bordetella pertussis
2.2.3. Legionella pneumophila
2.2.4. Zoonosis
2.2.4.1. Francisella tularensis
2.2.4.2. Bartonella henselae
2.3. Bacilli
2.3.1. MacConkey growth (Aerobic)
2.3.1.1. Glucose fermenting
2.3.1.1.1. Oxidase (-)
2.3.1.2. Glucose oxidizing
2.3.1.2.1. Oxidase (+)
2.3.1.2.2. Oxidase (-)
2.3.2. Obligate Anaerobe
2.3.2.1. Bacteroides fragilis
2.4. Curved
2.4.1. Virbrio cholerae
2.4.2. Campylobacter jejuni
3. Pleomorphic (No Gram Stain)
3.1. Mycoplasma pneumonia
3.2. Chlamydia trachomatis
3.3. Zoonosis
3.3.1. Rickettsia rickettsiae
3.3.2. Ehrlichia chaffeensis
3.4. Spirochete
3.4.1. Borrelia burgdorferi
3.4.2. Treponema pallidum
3.4.3. Leptospirosis sp.
3.5. Mycobacteria
3.5.1. M. tuberculosis
3.5.2. M. avium complex (MAC)
3.5.3. M. marinum