1. Populations microbiennes
1.1. Microbiote buccal
1.1.1. Bouche
1.1.1.1. Champignon: Candida albicans est une levure (champignon microscopique) présent dans la bouche des êtres humains.
1.1.1.2. Candidose: Candida a. est inoffensive, à l'origine de Candidoses
1.1.1.2.1. Maladies avec taches blanches douloureuses sur la langue ou le palais
1.2. Microbiote intestinal
1.2.1. Tube digestif
1.2.1.1. Préparation des aliments pour la digestion et l'évacuation des matières fécales
1.3. Microbiote vaginal
1.3.1. Vagin
1.3.1.1. constitué de bactéries appartenant au genre lactobacillus
1.3.1.2. Lactobacillus: bactérie formant une barrière sous-forme de biofilm
1.3.1.2.1. Biofilm: Protection contre l'agression de micro-organismes responsable d'infection diverses 3.L
1.4. Microbiote cutanée
1.4.1. Peau
1.4.1.1. Virus de la Varicelle (haut) Staphylococcus epidermidis (bactérie)
1.4.1.2. Bactérie formant une barrière sur la peau
1.4.1.2.1. Protection contre les pathogènes invasifs
1.4.1.2.2. Elimination thérapeutique du microbiome cutanée (antibiotique, désinfection)
2. Microbiote du système digestif
2.1. Estomac
2.1.1. 10 à 1000 bactéries /ml
2.1.2. Milieu oxygéné et acide
2.2. Intestin grêle
2.2.1. 10 000 à 10 millions de bactéries /ml
2.2.2. Acidité et oxygène se raréfiant progressivement
2.3. Côlon
2.3.1. 10 milliards à 10 000 milliards de bactéries /ml
2.3.2. Milieu sans oxygène ni acidité
2.4. Micro-organismes vivants /ml (cfu/ml)
3. Rôles
3.1. Immunité
3.1.1. Les bactéries de la flore intestinale
3.1.2. Participation à la fonction barrière de l'intestin en empêchant la colonisation par des espèces pathogènes
3.2. Digestion
3.2.1. Les micro-organismes assurent la fermentation des fibres alimentaires
3.2.1.1. Participation aux fonctions de protection de l'organisme
3.2.1.2. Agit contre la colonisation du tube digestif par des pathogènes
4. Localisation des micro-organismes
4.1. Peau
4.2. Yeux
4.3. Organes génitaux
4.4. Intestin grêle
4.5. Côlon
4.6. Ecosystèmes pour Intestin grêle et Côlon
4.6.1. Altéré par la prise d'antibiotiques
4.6.2. Par un bain de bouche antibactérien, par des savons
5. Perturbation et Conséquence
5.1. Maladies associées à un déséquilibre du microbiote
5.1.1. Maladie de Crohn
5.1.2. Diabète de type 1
6. Utilisation thérapeutique
6.1. Les chercheurs envisagent plusieurs pistes thérapeutiques
6.1.1. Alimentation en fibre
6.1.1.1. Riche
6.1.1.2. Diversifiée
7. Diversité bactérienne
7.1. Bactéroidetes
7.1.1. Bactéroides
7.1.2. Protovella
7.2. Proteobactéries
7.2.1. Escherichia coli
7.3. Firmicutes
7.3.1. Entérocoques
7.3.2. Streptocoques
7.3.3. Clostridium
7.3.4. Clostridium
7.4. Actinobacteria
7.4.1. Bifidobactéries
8. Composition de microbiote
8.1. Jeune enfant
8.1.1. Type digestif
8.1.1.1. Diversification, contact, maladies, traitements...
8.2. Bébe
8.2.1. Tube digestif
8.2.1.1. Contact avec le microbiote cutané de la mère
8.2.1.2. Bactéries dans le lait
8.3. Nouveau-né
8.3.1. Tube digestif
8.3.1.1. Contact avec le microbiote maternel (vaginal/intestinal)
8.3.1.2. Accouchement par voie basse
8.4. Foetus
8.4.1. Tube digestif
8.4.1.1. Stérile et absence de microbiote