1. Composition de microbiote
1.1. Jeune enfant
1.1.1. Type digestif
1.1.1.1. Diversification, contact, maladies, traitements...
1.2. Bébe
1.2.1. Tube digestif
1.2.1.1. Bactéries dans le lait
1.3. Contact avec le microbiote cutané de la mère
1.4. Nouveau-né
1.4.1. Tube digestif
1.4.1.1. Contact avec le microbiote maternel (vaginal/intestinal)
1.4.1.2. Accouchement par voie basse
1.5. Foetus
1.5.1. Tube digestif
2. Utilisation thérapeutique
2.1. Les bactéries de la flore intestinale
3. Participation aux fonctions de protection de l'organisme
4. Stérile et absence de microbiote
5. Rôles
5.1. Immunité
5.1.1. Participation à la fonction barrière de l'intestin en empêchant la colonisation par des espèces pathogènes
5.2. Digestion
5.2.1. Les micro-organismes assurent la fermentation des fibres alimentaires
5.2.1.1. constitué de bactéries appartenant au genre lactobacillus
5.2.1.1.1. Agit contre la colonisation du tube digestif par des pathogènes
6. Populations microbiennes
6.1. Microbiote buccal
6.1.1. Bouche
6.1.1.1. Candidose: Candida a. est inoffensive, à l'origine de Candidoses
6.1.1.1.1. Maladies avec taches blanches douloureuses sur la langue ou le palais
6.1.1.2. Champignon: Candida albicans est une levure (champignon microscopique) présent dans la bouche des êtres humains.
6.2. Microbiote intestinal
6.2.1. Tube digestif
6.3. Microbiote vaginal
6.3.1. Vagin
6.3.1.1. Lactobacillus: bactérie formant une barrière sous-forme de biofilm
6.3.1.1.1. Les chercheurs envisagent plusieurs pistes thérapeutiques
6.4. Préparation des aliments pour la digestion et l'évacuation des matières fécales
6.5. Microbiote cutanée
6.5.1. Peau
6.5.1.1. Virus de la Varicelle (haut) Staphylococcus epidermidis (bactérie)
6.5.1.2. Bactérie formant une barrière sur la peau
6.5.1.2.1. Protection contre les pathogènes invasifs
6.5.1.2.2. Elimination thérapeutique du microbiome cutanée (antibiotique, désinfection)
7. Microbiote du système digestif
7.1. Estomac
7.1.1. 10 à 1000 bactéries /ml
7.1.2. Milieu oxygéné et acide
7.2. Intestin grêle
7.2.1. 10 000 à 10 millions de bactéries /ml
7.2.2. Acidité et oxygène se raréfiant progressivement
7.3. Côlon
7.3.1. 10 milliards à 10 000 milliards de bactéries /ml
7.3.2. Milieu sans oxygène ni acidité
7.4. Micro-organismes vivants /ml (cfu/ml)
8. Biofilm: Protection contre l'agression de micro-organismes responsable d'infection diverses 3.L
9. Localisation des micro-organismes
9.1. Peau
9.2. Yeux
9.3. Organes génitaux
9.4. Intestin grêle
9.5. Ecosystèmes pour Intestin grêle et Côlon
9.5.1. Altéré par la prise d'antibiotiques
9.5.2. Par un bain de bouche antibactérien, par des savons
9.6. Côlon
10. Perturbation et Conséquence
10.1. Maladies associées à un déséquilibre du microbiote
10.1.1. Maladie de Crohn
10.1.2. Diabète de type 1
11. Diversité bactérienne
11.1. Bactéroidetes
11.1.1. Bactéroides
11.1.2. Protovella
11.2. Proteobactéries
11.2.1. Escherichia coli
11.3. Firmicutes
11.3.1. Entérocoques
11.3.2. Streptocoques
11.3.3. Clostridium
11.3.4. Tactobacilles
11.4. Actinobacteria
11.4.1. Bifidobactéries