2.2. Departamento de Conservação Florestal e Serviços Ambientais
3. Secretaria de Áreas Protegidas
3.1. Departamento de Concessões
3.2. Departamento de Áreas Protegidas
4. Secretaria de Clima e Relações Internacionais
4.1. Departamento de Relações Internacionais
4.2. Departamento de Clima
4.3. Departamento de Florestas e de Combate ao Desmatamento
4.4. Departamento de Monitoramento, Apoio e Fomento de Ações em Mudança do Clima
5. Secretaria de Biodiversidade
5.1. Departamento de Educação e Cidadania Ambiental
5.2. Departamento de Patrimônio Genético
5.3. Departamento de Espécies
5.4. Departamento de Áreas Protegidas
5.5. Departamento de Conservação de Ecossistemas
6. Órgãos Colegiados
6.1. Conselho Nacional de Meio Ambiente (Conama)
6.2. Conselho Deliberativo do Fundo Nacional do Meio Ambiente
6.3. Conselho de Gestão do Patrimônio Genético (CGen)
6.4. Comissão Nacional de Florestas (Conaflor)
6.5. Comitê Gestor do Fundo Nacional sobre Mudança do Clima
6.6. Comissão Nacional de Combate à Desertificação (CNCD)
6.7. Comitê Gestor do Fundo Nacional para Repartição de Benefícios (FNRB)
6.8. Comissão Nacional para Recuperação da Vegetação Nativa (Conaveg)
6.9. Comissão Nacional para Redução das Emissões de Gases de Efeito Estufa Provenientes do Desmatamento e da Degradação Florestal, Conservação dos Estoques de Carbono Florestal, Manejo Sustentável de Florestas e Aumento de Estoques de Carbono Florestal (Conaredd)
6.10. Conselho Nacional da Amazônia Legal
6.11. Conselho Nacional de Recursos Hídricos
6.12. Comissão de Gestão de Florestas Públicas
6.13. Comitê Orientador do Fundo Amazônia (COFA) e Comitê Técnico do Fundo Amazônia (CTFA)
7. Secretaria de Articulação Institucional e Cidadania Ambiental
7.1. Departamento de Educação Ambiental
7.2. Departamento de Articulação Institucional
7.3. Departamento de Desenvolvimento, Produção e Consumo Sustentáveis
8. Secretaria de Extrativismo e Desenvolvimento Rural Sustentável
8.1. Departamento de Extrativismo
8.2. Departamento de Desenvolvimento Rural Sustentável e de Combate à Desertificação
9. Secretaria de Qualidade Ambiental
9.1. Departamento de Gestão Ambiental Territorial
9.2. Departamento de Gestão de Resíduos e Qualidade do Solo
9.3. Departamento de Gestão de Qualidade do Ar e das Águas
9.4. Departamento de Revitalização de Bacias Hidrográficas e Acesso à Água