1. A transcrição é o nome que se dá à formação de RNA a partir de uma fita de DNA, havendo a “cópia” das informações contidas no DNA para o RNA.
1.1. Uma molécula de DNA terá suas duas cadeias afastadas, e nucleotídeos livres de RNA se ligarão a um dos filamentos. Essa fita de RNA formada sob o controle da enzima RNA-polimerase se destacará da fita molde de DNA e se deslocará para o citoplasma. Já as duas cadeias de DNA se ligarão novamente.
2. Alongamento das Cadeias de RNA: Ocorre dentro da bolha de transcrição.
2.1. A polimerase continuamente desenrola o DNA a sua frente e enrola o DNA que está atrás do sítio de transcrição (já foi transcrito).
2.2. A cadeia de RNA nascente vai se desligando do DNA à medida que a RNA polimerase se move pela dupla hélice. A região de pareamento DNA-RNA é muito curta (cerca de três pares de bases).
3. Término: Ocorre quando a RNA polimerase encontra um sinal de término – o complexo de transcrição se dissocia e há liberação da molécula de RNA.
3.1. Existem dois tipos de terminadores em E. coli: Terminadores dependentes de RHO (resulta no término da transcrição apenas na presença da proteína chamada RHO) Terminadores independentes de RHO (resulta no término da transcrição sem o desenvolvimento da proteína RHO).
3.1.1. Os terminadores independentes de RHO: apresentam sequências nucleotídicas ( rica em C:G seguida de seis ou mais pares de bases A:T, com os A presentes no filamento molde) capazes de formar grampos (dificultam o movimento da RNA polimerase pela cadeia de DNA). Os grampos são seguidos de uma sequência rica em A (a ligação A-U é facilmente rompida facilitando a liberação do RNA transcrito).
3.1.2. Os terminadores dependentes de RHO: Esse mecanismo ainda é incerto. As sequências de terminação dependente de RHO são de 50 a 90 pares de base de comprimento, e especificam transcritos de RNA que são ricos em unidades C e sem unidades G. A proteína RHO se liga à cadeia crescente de RNA e se move de 5’ para 3’ ao longo da cadeia do RNA. Quando a RNA polimerase diminui ou para na sequência de terminação de RHO, a RHO se liga à polimerase e retira o RNA da bolha de transcrição.