1. Kepentingan
1.1. RMS - 1950 (Soumokil, Maluku)
1.1.1. Separatisme, pendukung RI ditangkap pasukan Soumokil
1.1.2. Penumpasan: Gerakan Operasi Militer III (Kolonel A. E. Kawilarang)
1.2. APRA - 1950 (Raymond Westerling, Jawa Barat)
1.2.1. Negara Pasundan
1.2.2. Ratu Adil → untuk menarik simpati rakyat
1.2.3. Didukung Sultan Hamid II
1.2.4. Ditumpas oleh APRIS
1.2.5. Westerling melarikan diri (pesawat Catalina)
2. Ideologi
2.1. PKI Madiun - 1948 (Amir Syarifuddin, Musso)
2.1.1. Latar Belakang
2.1.1.1. Perjanjian Linggarjati dan Renville
2.1.1.2. Kabinet Amir Syarifuddin diganti Hatta akibat mosi
2.1.2. Jalannya
2.1.2.1. Pembentukan FDR
2.1.2.2. Jalan Baru Musso
2.1.2.3. Proklamasi Negara Republik Soviet Indonesia
2.1.2.4. Bentrokan dengan TNI di Solo
2.1.2.5. Provokasi mogok kerja
2.1.3. Penumpasan: Gatot Subroto
2.2. G-30S/PKI - 1965 (D. N. Aidit, Jakarta)
2.2.1. Isu Dewan Jenderal
2.2.1.1. Fitnah kudeta TNI AD
2.2.2. Isu Dokumen Gilchrist
2.2.2.1. Fitnah dukungan Amerika Serikat dan Inggris dalam kudeta TNI AD
2.2.3. Pembunuhan perwira AD di Lubang Buaya (Letkol Untung)
2.2.4. Penumpasan: Letkol Soeharto
2.3. DI/TII - 1948 ~ 1965
2.3.1. Jawa Barat (Kartosuwiryo)
2.3.1.1. Latar belakang: Perjanjian Renville
2.3.1.2. Penumpasan: Operasi Bharatayudha (strategi pagar betis)
2.3.2. Jawa Tengah (Amir Fatah)
2.3.2.1. Latar belakang: Perjanjian Renville
2.3.2.2. Penumpasan: Gerakan Banteng Negara
2.3.3. Sulawesi Selatan (Kahar Muzakar)
2.3.3.1. Latar belakang: KGSS tidak diakui menjadi TNI/APRIS
2.3.3.2. Penumpasan: Operasi militer
2.3.4. Aceh (Daud Beureuh)
2.3.4.1. Latar belakang: Aceh turun status menjadi karesidenan
2.3.4.2. Penumpasan: Konsolidasi oleh Mohammad Jasin
3. Sistem Pemerintahan
3.1. Andi Azis - 1950 (Sulawesi Selatan)
3.1.1. Kelompok pro-federal membentuk Pasukan Bebas
3.1.2. Penyerandan Markas TNI Makassar
3.1.3. Ultimatum pemerintah 4 x 24 jam
3.1.4. Penumpasan: Kolonel A. E. Kawilarang
3.2. PRRI/Permesta - 1958
3.2.1. Latar Belakang
3.2.1.1. Pembangunan tidak merata
3.2.1.1.1. Ketidakpuasan
3.2.2. PRRI (Sulawesi)
3.2.2.1. Dewan Manguni (Kolonel Ventje Sumual, Manado)
3.2.2.2. Penumpasan: Operasi 17 Agustus (Letkol Ahmad Yani)
3.2.3. Permesta (Sumatera)
3.2.3.1. Dewan Banteng (Achmad Husein, Sumatera Barat)
3.2.3.1.1. Ultimatum 5 x 24 jam untuk mengganti Kabinet Djuanda
3.2.3.2. Dewan Gajah (Kolonel Simbolon, Medan)
3.2.3.3. Dewan Garuda (Letkol Barlian, Sumatera Selatan)
3.2.3.4. Penumpasan: Operasi Merdeka (Letkol Rukminto Hendraningrat)
3.2.4. Keterlibatan Amerika Serikat
3.2.4.1. Latar belakang: Perang Dingin
3.2.4.2. Bukti: Pesawat A. L. Pope yang tertembak jatuh di Ambon