
1. Genoma Eucariota
1.1. complexidade
1.1.1. valor C
1.1.1.1. qtd ADN/célula haplóide
1.1.1.2. não existe uma boa correlação entre o valor C e a complexidade
1.1.1.3. >ia do ADN não é expresso
1.1.1.3.1. junkDNA?
1.1.2. Mínimo do valor C
1.2. / gene --x--> / proteina / genoma -x-> / complexidade
1.2.1. Intrões/exões
1.2.1.1. __
1.2.1.1.1. procariotas
1.2.1.1.2. eucariotas inferiores
1.2.1.1.3. eucariotas superiores
1.2.1.2. GENES RELACIONADOS têm ORGANIZAÇÕES (I-E) //
1.2.1.2.1. Manutenção da estrutura de exões e intrões
1.2.1.2.2. Familia das globulinas
1.2.1.2.3. mesmo exemplo com genes DHFR
1.2.1.3. EXÕES de genes RELACIONADOS são + // q intrões
1.2.1.3.1. [-] dif nos exões
1.2.1.4. excepções
1.2.1.4.1. leguemoglobina (+ 1 intrão)
1.2.1.4.2. gene insulina mamífs (-1 intrão)
1.2.2. genes sobrepostos
1.2.2.1. proteinas homólogas
1.2.2.1.1. = frame
1.2.2.2. n homólogas
1.2.2.2.1. grelha de leitura dif
1.2.3. Splicing alternativo
1.2.3.1. ex
1.2.3.1.1. troponina T (ratinho)
1.2.3.1.2. H tem menos genes q esperado...
1.3. Classificação ADN
1.3.1. genes codificantes
1.3.1.1. RNA
1.3.1.1.1. genes multicópia
1.3.1.2. proteinas
1.3.1.2.1. cópia única
1.3.1.2.2. famílias génicas
1.3.2. DNA repetido
1.3.2.1. DNA satélite
1.3.2.1.1. alta/ repetido
1.3.2.1.2. seq peq (< 100 pb)
1.3.2.1.3. em tandem
1.3.2.2. disperso
1.3.2.2.1. __
1.3.2.2.2. __
1.4. EXON shuffling
1.4.1. ORIGEM INTRÕES
1.4.1.1. modelo "introns early"
1.4.1.1.1. Ancestral com intrões
1.4.1.1.2. EXON SHUFFLING
1.4.1.2. modelo "introns late"
1.4.1.2.1. Ancestral sem intrões
1.4.1.2.2. tRNA com intrões
1.4.2. Exão <--> domínio (c/ função esp.)
1.4.2.1. ex
1.4.2.1.1. insulina
1.4.2.2. exões --> módulos
1.4.2.3. varios exões podem --> = função
2. Regulação génica em procariotas
2.1. Modelo de Britten e Davidson (1970)
2.1.1. __
2.1.1.1. sequências sensor
2.1.1.2. genes integradores (reguladores)
2.1.1.3. genes estruturais
2.1.1.4. (factores de transcrição)
2.2. Eucariotas sem operões
2.2.1. Maior flexibilidade de regulação
3. Origem dos Eucariotas
3.1. Procariotas
3.1.1. complexidade menor
3.1.2. Cromossoma circular
3.1.3. Actividades celulares pouco localizadas
3.1.4. Poucas proteinas associadas ao ADN
3.1.5. valor C menor (qtd ADN/celula haploide)
3.1.6. Linhagens verticais
3.1.7. Recombinação génica só por transferência horizontal de genes (THG)
3.2. Eucariotas
3.2.1. Maior complexidade
3.2.2. Maior valor C (saccharomyces cerevisiae tem valor C > a qq prok)
3.2.3. Cromossomas lineares
3.2.4. Compartimentação física e funcional
3.2.5. Muitas proteinas associadas ao ADN
3.2.6. Recombinação génica por THG e meiose
3.2.6.1. Crossing-over
3.2.6.2. Segregação independente
3.2.7. > EVOLUÇÃO
3.3. Teorias
3.3.1. Archeae
3.3.1.1. Eocito
3.3.1.1.1. Eucariota
3.3.1.2. Mitocondria (a-purple) e cloroplastos (plantas - cianobactéria)
3.3.1.3. genes // eubactérias por THG
3.3.1.3.1. preferencial para um grupo de bactérias
3.3.1.4. Hipótese clássica
3.3.2. Quimérica
3.3.2.1. Bactéria Gram -
3.3.2.1.1. Eócito
3.3.2.2. Eócito
3.3.2.2.1. Bactéria Gram -
3.4. Homologias proteícas
3.4.1. c/ Eubacteria
3.4.1.1. Proteinas metabólicas
3.4.1.2. Genes mitocondriais
3.4.2. c/ Archeae
3.4.2.1. genes do aparelho de expressão génica
3.4.2.2. genes do aparelho de obtenção de energia