1. tutkittavasta kudoksesta eristetään kaikki lähetti-rna-molekyylit
1.1. lähetti-rna muutetaan vastin-dna:ksi (komplementaarinen dna) käänteiskopioijaentsyymien avulla
1.1.1. liitetään väriaine komlementaariseen dna:han
2. Menetelmiä joiden avulla dna:ta voidaan eristää, tutkia, muokata ja siirtää
3. komplementaarinen dna
3.1. valmistetaan lähetti-rna:n emäsjärjestyksen perusteella käänteiskopioijaentsyymin avulla
3.2. Introneiden poisto
4. Tunnetuilla alukkeilla rajattujen alueiden monistus tutkittavasta dna:sta polymeraasi-entsyymin avulla.
5. restriktioentsyymi
5.1. pilkkoo dna:ta
5.2. bakteerien puolustuskeino bakteriofageja vastaan
5.3. katkaisukohdat voivat olla tahmeita tai tylppiä
6. dna-siru
7. Geenitekniikka
8. C-DNA
9. Katkaisuentsyymi
10. Liittäjäentsyymi
10.1. ligaasientsyymi
10.1.1. liittää katkaistut juosteet yhteen
10.1.2. korjaa juosteen sokerifosfaattirungon
11. PCR
11.1. Polymeraasiketjureaktio
11.2. Pienikin näyte saadaan monistettua tutkittavaksi
11.3. Vaiheet:
11.3.1. 1. Dna:n juosteiden irtoaminen toisistaan
11.3.2. 2. Alukkeiden hybridisaatio kohde-dna:han
11.4. Dna:n hybridisaatio
11.4.1. Toisiaan vastaavien yksijuosteisten dna-palojen pariutuminen emäsparisäännön mukaan
11.4.2. Käytetään tiettyä emäsjärjestystä vastaavien emäsjaksojen tunnistamiseen kohteesta
12. Aluke
12.1. Lyhyt yksijuosteinen dna-jakso
12.1.1. Noin kahdenkymmenen emäksen mittainen
12.1.2. Vastaa tiettyä emäsjärjestystä
12.2. Tarvitaan dna:n monistamiseen PCR-menetelmällä
12.2.1. Toimii dna-synteesin aloituskohtana dna-polymeraasille
13. Elektroforeesi
13.1. nukleiinihappomolekyylit kulkeutuvat sähkökentässä liikkumista hidastavassa geelissä
13.1.1. mitä lyhyempi molkyyli niin sitä nopeammin pääsee liikkumaan
13.1.2. negatiivisen varauksen omaavat nukleiinihapot liikkuvat geelissä kohti positiivista varausta
13.1.3. värjätty sopivalla väriaineella
13.2. käytetään dna- ja rna-palojen havaitsemiseen
14. sekvensointi
14.1. selvitetään dna:n emäsjärjestystä
14.1.1. reaktiossa on aloituskohdan määräävä aluke, tavallisia nukleotidejä ja rakentamisen päättäviä lopetusemäksiä
14.1.1.1. muokattu mahdottomaksi uusien nukleotidien littymiselle
14.1.1.1.1. syntyy kaikkia mahdollisia erimittaisia leimattuja pätkiä
14.2. jokainen neljä emästä värjätään eri värisiksi
14.3. sekvenssit yleensä tallennetaan jukkisiin tietokantoihin
14.3.1. muut tutkijat voivat vertailla ja poimia tietoja
15. koetin
15.1. Yksijuosteinen dna-pätkä, joka vastaa tutkittavaa aluetta
15.1.1. 3. Uuden dna-juosteen rakentuminen polymeraasin avulla
15.1.1.1. lasinen alustalevy, johon on kiinnitetty tutkittavien geenien emäsjärjestystä vastaavaa yksijuosteista dna:ta pieninä pisaroina tasaisin välimatkoin
15.1.1.1.1. lasille mahtuu tuhansia pisaroita
15.1.1.1.2. tutkitaan geenin ilmentymista l-Rnan avulla