2. MUESTRAS DIGESTIVAS BAJAS En este apartado se incluyen la biopsia rectal empleada para la detección de Entamoeba histolytica, el HSV y Balantidium coli, y las muestras tomadas por sigmoidoscopia para la detección de E.histolytica, micobacterias y colitis seudomembranosa por C. difficile y S. aureus. A- MATERIAL NECESARIO - Sigmoidoscopio, rectoscopio y material complementario. - Pipetas. - Tubos de tapón de rosca estériles con o sin solución salina. - Tubo de trasporte para anaerobios. B-TOMA DE MUESTRA Biopsia rectal: emplear pinzas para tomar muestras de las lesiones o de la mucosa rectal posterior a unos 7-10cm del esfinter anal. Sigmoidoscopia: toma con pinzas o con pipeta, para la búsqueda de parásitos se realizan después de la defecación normal o 2-3 horas después de una defecación conseguida con laxantes. C-TRANSPORTE - En tubo de tapón de rosca. Si la muestra es pequeña o se va a dilatar el envío se emplearán tubos con solución salina para evitar la desecación. - El envío debe ser inmediato y la conservación adecuada; si se sospecha C. difficile emplear medio para transporte de anaerobios. Para la búsqueda de parásitos se envía inmediatamente al laboratorio, en su defecto las muestras tomadas con pipeta se incluirán en fijador. ( Ver Sección Parasitología)
3. LAVADO GÁSTRICO Muestra para investigación de BK preferentemente en niños. MATERIAL NECESARIO - Tubo de lavado gástrico - Recipientes estériles de boca ancha, tubos con tapón de rosca. - Suero fisiológico estéril . TOMA DE MUESTRAS - Lavado gástrico para estudio de micobacterias. VOLUMEN MÍNIMO - Todo lo que se recoge. TRANSPORTE - Envío rápido al laboratorio, de lo contrario refrigerar a 4oC hasta 24 horas.
4. BIOPSIA GASTRICA-ANTRAL OBTENIDA POR ENDOSCOPIA Se utiliza para la búsqueda de Helicobacter pylori, agente causal en casos de úlceras duodenales o gástricas. A.- MATERIAL NECESARIO - Fibrogastroscopio y material complementario. - Tubos con suero fisiológico (1 ml) para pequeñas muestras. - Forma para muestras a enviar a anatomía patológica. B.- TOMA DE MUESTRAS - Introducir el endoscopio y recoger muestras de biopsia de las lesiones sospechosas. . - Es fundamental obtener varias muestras tanto de la base como de los cuatro cuadrantes del margen de la úlcera, sin olvidar la biopsia de la mucosa antral. - Las biopsias para estudio bacteriológico se colocan en tubo con suero fisiológico. CTRANSPORTE - Transporte inmediato al laboratorio
5. MATERIAS FECALES Esta muestra se utiliza para el diagnóstico etiológico de gastroenterocolitis aguda. Excepcionalmente se puede utilizar para la búsqueda de portadores de Salmonella sp. En los laboratorios de Microbiología de índole asistencial de adultos se realiza búsqueda de Salmonella y Shigella. Si se sospechan otros agentes consultar con el Laboratorio de Microbiología. A.- MATERIAL NECESARIO - Recipiente de boca ancha para recoger las heces, no es necesario que esté estéril, solo es preciso que esté limpio. No contendrá restos de jabones, detergentes, desinfectantes o iones metálicos. - Recipiente estéril de boca ancha y cierre hermético para enviar la muestra. ( ejemplo: frasco de urocultivos). La muestra de heces para colocar en el frasco se recoge con espátula o bajalenguas. - Medios de transporte para heces. Se emplean solo si el envío de la muestra se demora y se solicita en laboratorio de Microbiología. Existen sistemas comerciales para bacterias. ( Cary- Blair o solución de glicerol tamponado) B.- OBTENCIÓN DE LA MUESTRA - Solo se procesan materias líquidas o a lo sumo pastosas. - Si son pastosas se toma una porción del recipiente donde hayan sido emitidas y se transfieren al sistema elegido para el envío al laboratorio. Se seleccionan las partes con mucus, pus o sangre. - En caso de heces líquidas puede utilizarse jeringa para aspirado del material fecal del recipiente en donde ha sido emitido. - No se procesarán las muestras de materias sólidas ni contaminadas con orina. C.- VOLUMEN MINIMO Heces pastosas: muestras del tamaño de una nuez son muy adecuadas pues permiten realizar la mayoría de los estudios. Heces líquidas entre 5 y 10 ml. D.- TRANSPORTE - Si la muestra no se envia en forma inmediata se debe refrigerar. - Si se va a procesar en el plazo de 1 o 2 horas después de su emisión, no necesitan medio de transporte. - En caso contrario se remiten las materias en un sistema de transporte para enteropatógenos. Mientras tanto mantener refrigerada las muestras, para evitar el sobrecrecimiento de la flora normal que puede enmascarar o destruir a los enteropatógenos. El frío puede afectar la viabilidad de Shigella spp. - Para el estudio de toxinas de Clostridium difficile la muestra se puede mantener hasta 48 horas refrigerada a 4 o en la heladera. - Es preferible enviar las muestras para estudio virológico sin medio de cultivo, pues este diluye las partículas virales disminuyendo la sensibilidad. Si su envío se retrasa mucho utilizar medio de transporte y recipientes colocados en hielo. E.- OBSERVACIONES - Las muestras para coprocultivo, deberán tomarse antes de la administración de antimicrobianos y preferiblemente antes de tomar antidiarreicos. - Indicar siempre el juicio diagnóstico de presunción y si el paciente es menor de un año. - Solicitar las investigaciones especiales explícitamente ( C. difficile, C. perfringens, S. aureus ,etc) - En el caso de búsqueda de portadores de Salmonella, se deberá fundamentar adecuadamente el pedido y se necesitan 3 muestras negativas para asegurar que el paciente no es portador. - Muestras para investigación de enteroparásitos ver Sección Parasitología
6. HISOPOS RECTALES Para conocer la etiología en el caso de una gastroenteritis aguda se debe utilizar una muestra de materia fecal. Los hisopos rectales solo se aceptarán en casos en que no se puedan obtener heces, por ejemplo en neonatos o adultos debilitados, o internados en unidades de cuidados intensivos. Se ha demostrado eficaz en el aislamiento de Neisseria gonorrhoeae, Campilobacter spp, Shigella spp, C. difficile, virus del Herpes simplex y en portadores anales de Streptococcus pyogenes. No es válido para la búsqueda de antígenos. A.- MATERIAL NECESARIO - Hisopos con medio de transporte - Guantes. B.- OBTENCIÓN DE LA MUESTRA - Para realizar la toma se introduce el hisopo sobrepasando el esfínter anal y se rota para hacer la toma de las criptas anales, mantener allí durante 30 segundos para que se absorban los microorganismos y retirar. - Una vez realizado se introduce en un medio de transporte. C.- TRANSPORTE Se envían en medio de transporte adecuado ( Stuart, Cary-Blair, para anaerobios en el caso de C. difficile), pues así se protege a las bacterias de la desecación y se envía rápidamente al laboratorio. D. OBSERVACIONES Son muestras inadecuadas: Hisopos rectales secos. Hisopos rectales sin medio de transporte. Hisopos con heces cuando se busquen bacterias diferentes de enteropatógenos.
7. BIBLIOGRAFÍA 2. Koneman EW, Allen SD, Janda WM ,Schreckenberger PC, Winn WC. The Role of the Microbiology Laboratory in the Diagnosis of Infectious Diseases: Guideline to Practice and Management. En: Diagnostic Microbiology. 5th ed. Philadelphia: JB Lipincott Company, 1997; 2:69-120 3. Murray PR, Baron EJ, Pfaller MA, Tenover FC, Yolken RH. Specimen Collection, Transport, and Storage. En: Manual of Clinical Microbiology 7th ed. American Society for Microbiology, Washington DC 1999 ,4: 33-63 4. Murray PR. Specimen Collection and Transport. En: ASM Pocket Guide to Clinical Microbiology 1996 Washington, 1996; 3: 40-70 5. Miller JM. Specimen Collection and Processing. En: A Guide to Specimen Management in Clinical Microbiology 1996. American Society for Microbiology, Press Wasington DC1996; 3: 37-115
