BASES DE DATOS BIOLÓGICAS

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BASES DE DATOS BIOLÓGICAS por Mind Map: BASES DE DATOS BIOLÓGICAS

1. Bases con quienes colabora

2. ¿Para que sirven las bases de datos?

2.1. Las funciones principales de las bases de datos son la de almacenar,estructurar,organizar,y sobre todo manipular los datos biologicos.

2.2. A su vez crecen en proporciones gigantescas esto genera que sean usadas por cientificos experimentales

2.2.1. Base de datos

3. ¿Que son las bases de datos biológicas?

3.1. Son bases que incluyen datos de secuencias de nucleotidos,proteinas,genomas,expresión genética, taxonómica, etc

4. Diferentes bases de datos

4.1. Bases de datos de secuencias de nucleotidos

4.1.1. NCBI(EEUU)

4.1.1.1. EMBL(Europa)

4.1.1.1.1. DDBJ(Japón)

4.2. Base de datos de genomas de organismos completos

4.2.1. Flybase(Drosophilia)

4.2.2. SGD(levadura)

4.2.3. Thair(Arabidopsis)

4.2.4. lENSEML(Hombre,ratón, otros)

4.3. Principales bases de datos de proteinas

4.3.1. MMDB

4.3.2. Scop

4.3.3. Uniprot

4.3.4. Swiss-Prot

4.3.5. PDB

5. Bases de Datos de secuencias de nucleotidos

5.1. ¿Que es?

5.1.1. Es una colección de secuencias de ADN y proteínas

5.1.2. Las 3 bases de datos principales son; NCBI,EMBL y DDBJ.

6. GenBank

6.1. ¿Que es en GenBank?

6.1.1. El GenBank eses la base de datos de secuencia genética NIH, una colección comentada de todas las secuencias de ADN disponibles públicamente

6.1.2. Forma parte de la International Nucleotide Sequence Database Collaboration

6.2. ¿Cual es su funcion?

6.2.1. Esta organización intercambian datos diariamente. GenBank y sus colaboradores reciben secuencias genéticas producidas en laboratorios de todo el mundo, procedentes de más de 100.000 organismos distintos. GenBank continua creciendo a ritmo exponencial, doblando la cantidad de información contenida cada 10 meses.

6.2.2. La base de datos GenBank está diseñada para proporcionar y alentar el acceso dentro de la comunidad científica a la información de secuencia de ADN más actualizada y completa.

7. DDBJ

7.1. ¿Que es?

7.1.1. El DDBJ recopila datos de secuencias de nucleótidos como miembro de INSDC (Colaboración internacional de bases de datos de secuencias de nucleótidos) y proporciona datos de secuencias de nucleótidos y sistemas de supercomputadores disponibles de forma gratuita para apoyar las actividades de investigación en ciencias de la vida.

7.1.1.1. Imagen

7.2. Mision

7.2.1. El propósito principal de las operaciones de DDBJ es mejorar la calidad de INSD, como dominios públicos. Cuando los investigadores hacen que sus datos estén abiertos al público a través del INSD y se compartan comúnmente en todo el mundo.

7.2.2. Otra mision es que la información sea la mas accesible y rica para que este disponible para cualquier persona del mundo.

7.3. Actividades principales

7.3.1. Recopila secuencias de nucleótidos de investigadores

7.3.2. Trabaja conjuntamente con la INSD(BAse de datos interncional de secuencia de nucleotidos),

7.3.3. Recopila datos de secuencia principalmente de investigadores japoneses, pero, por supuesto, acepta datos y emite los números de acceso a los investigadores en cualquier otro país.

8. EMBL

8.1. ¿Que es?

8.1.1. Es el laboratorio europe de biologia molecular, es una institucion de investigacion sobre la biologia molecular.

8.1.1.1. Instalciones

8.1.2. Las funciones del EMBL son: La realización de investigación básica en biología molecular, aprendizaje y entrenamiento de científicos, estudiantes y visitantes en todos los niveles

8.2. ¿A que se dedica?

8.2.1. Proporciona datos de libre acceso y servicios de bioinformática a la comunidad científica

8.2.2. Contribuye al avance de la biología a través de investigaciones impulsadas por investigadores.

8.2.3. Brinda a la capacitación avanzada en bioinformática a científicos de todos los niveles.

9. INSDC

9.1. International Nlceotide Secuencie