Nanomecanica de proteinas

1. Cizallas, cremalleras y talones de aquiles

1.1. topografia del punto de ruptura

1.1.1. Cizallas, la fuerza actua perpendicularmente a los enlaces por puentes de hidrógeno que mantienen la estructura de la barrera mecanica de principal

1.1.2. cremallera: la fuerza es paralela a la dirección de los puentes de hidrógeno que se mantiene en la barrera mecánica, los enlaces resisten en serie el efecto de la fuerza

1.1.3. la lisina es uno de los veinte aminoacidos estandar, cabe la posibilidad de que represente al "talon de aquiles"

1.2. las poliubicuitinas sirven para marcar las proteínas que van a ser degradas por la ruta de proteasoma.

2. la robustez de las proteinas

2.1. la estructura de las proteínas consiste en susesion de aminoácidos y enlaces.

2.1.1. estructura secundaria: son plegamientos de las cadenas regulares de la cadena anterior

2.1.1.1. secundaria: helices, tienen forma helicoidal cilidrica

2.1.1.2. secundaria: hebras, son cadenas extendidas que tienden a asociarse en forma zigzagueante

2.1.2. estructura terciaria: consiste en los plegamientos adicionales que sufren las estructuras secundarias

2.2. una fuerza mecánica aplicada convenientemente a una molécula de proteína tiene tendencia a desplegarse

2.3. al ultilizar el microscopio de fuerza atomica se puede detectar y medir la estabilidad mecánica de las barreras de resistencia que presenta una proteína al estiramiento, así como su localizacion

2.4. las laminas de hebras que presentan puentes de hidrógeno en posición perpendicular(dominio de inmunoglobina de tinina,fibronectina y tenascina) y paralela(dominio de C2A de sinaptotagmina) forman estos puentes estrategicamente situados forman "veleros moleculares"

3. introducción: la célula posee numeroso complejos proteicos que funcionan como dispositivos mecánicos, con el microscopio de fuerza atómica podemos observar estas estructuras

4. biomaquinas mecanicas

4.1. los amortiguadores mecanicos ademas de estar presentes en el sarcómero, tambien son importantes en otras maquinarias en los que abundan proteinas modulares

4.2. existen otros motores proteicos como las "despliegas" que despliegan otras proteínas como primera etapa de su procesamiento

4.2.1. también encontramos la chaperonina bacteriana GroEL, y es una maquina compuesta por diversas proteínas encargadas de corregir las alteraciones estructurales de otras proteinas

4.2.2. tambien encontramos las translocasas y las proteasas compartimentalizadas, maquinas responsables del proceso de translocación o transito de sus proteínas sustrato a travez de la membrana celular

4.3. trinquetes brownianos, dispositivos que convierten el carácter aleatorio del movimiento browniano de las proteínas en el procesos direcionales

5. el muelle del sarcómero

5.1. es la unidad contractil del musculo, se trata de una especializacion del esqueleto celular formada por tres tipos de proteinas que se organizan en filamentos ensamblados en forma de piston

5.1.1. filamento grueso(miosinas) es el motor que genera gracias a la hidrólisis del ATP, el trabajo mecánico de la contracción al desplazarse

5.1.2. filamento fino(actina) actúa como un rail rigido.

5.1.3. tercer filamento(titina) constituye un verdadero muelle que mantiene centrado el sarcomero y propociona elasticidad

5.2. la titina es utilizada para el estudio de la elasticidad y permite la reconstrucción de la elasticidad global de la proteína

5.3. las simulaciones de la elasticidad permite y ayuda a explicar la elasticidad de las proteinas

6. liliput convulso: maquinas proteinicas

6.1. las particulas de proteinas en solucion acuosa son bombardeadas por moleculas de agua

6.1.1. a esto se le llama: el "movimiento Browniano"

6.2. las maquinas proteicas han evuluvionadoen el sentido de: mantener su estructura y los cambios de conformacion de escperimentos durante su funcionamiento

6.3. las barreras termicas de la proteinas se oponen al cambio de forma

6.3.1. garantizan estabilidad termica a la proteina

6.3.2. los cambios de conformación y las interreacciones

6.4. algunas maquinas proteicas poseen barreras mecánicas que permiten mantener su estructura cuando sufren estrés mecanico

6.5. algunos tipos de motores proteicos

6.5.1. ATP, ATP sintasa, ARN, polimerasa, la miosina, la quinesina y la proteina portal del virus bacteriano (ADN viral)