1. Origem dos Eucariotas
1.1. Procariotas
1.1.1. complexidade menor
1.1.2. Cromossoma circular
1.1.3. Actividades celulares pouco localizadas
1.1.4. Poucas proteinas associadas ao ADN
1.1.5. valor C menor (qtd ADN/celula haploide)
1.1.6. Linhagens verticais
1.1.7. Recombinação génica só por transferência horizontal de genes (THG)
1.2. Eucariotas
1.2.1. Maior complexidade
1.2.2. Maior valor C (saccharomyces cerevisiae tem valor C > a qq prok)
1.2.3. Cromossomas lineares
1.2.4. Compartimentação física e funcional
1.2.5. Muitas proteinas associadas ao ADN
1.2.6. Recombinação génica por THG e meiose
1.2.6.1. Crossing-over
1.2.6.2. Segregação independente
1.2.7. > EVOLUÇÃO
1.3. Teorias
1.3.1. Archeae
1.3.1.1. Eocito
1.3.1.1.1. Eucariota
1.3.1.2. Mitocondria (a-purple) e cloroplastos (plantas - cianobactéria)
1.3.1.3. genes // eubactérias por THG
1.3.1.3.1. preferencial para um grupo de bactérias
1.3.1.4. Hipótese clássica
1.3.2. Quimérica
1.3.2.1. Bactéria Gram -
1.3.2.1.1. Eócito
1.3.2.2. Eócito
1.3.2.2.1. Bactéria Gram -
1.4. Homologias proteícas
1.4.1. c/ Eubacteria
1.4.1.1. Proteinas metabólicas
1.4.1.2. Genes mitocondriais
1.4.2. c/ Archeae
1.4.2.1. genes do aparelho de expressão génica
1.4.2.2. genes do aparelho de obtenção de energia
2. Genoma Eucariota
2.1. complexidade
2.1.1. valor C
2.1.1.1. qtd ADN/célula haplóide
2.1.1.2. não existe uma boa correlação entre o valor C e a complexidade
2.1.1.3. >ia do ADN não é expresso
2.1.1.3.1. junkDNA?
2.1.2. Mínimo do valor C
2.2. / gene --x--> / proteina / genoma -x-> / complexidade
2.2.1. Intrões/exões
2.2.1.1. __
2.2.1.1.1. procariotas
2.2.1.1.2. eucariotas inferiores
2.2.1.1.3. eucariotas superiores
2.2.1.2. GENES RELACIONADOS têm ORGANIZAÇÕES (I-E) //
2.2.1.2.1. Manutenção da estrutura de exões e intrões
2.2.1.2.2. Familia das globulinas
2.2.1.2.3. mesmo exemplo com genes DHFR
2.2.1.3. EXÕES de genes RELACIONADOS são + // q intrões
2.2.1.3.1. [-] dif nos exões
2.2.1.4. excepções
2.2.1.4.1. leguemoglobina (+ 1 intrão)
2.2.1.4.2. gene insulina mamífs (-1 intrão)
2.2.2. genes sobrepostos
2.2.2.1. proteinas homólogas
2.2.2.1.1. = frame
2.2.2.2. n homólogas
2.2.2.2.1. grelha de leitura dif
2.2.3. Splicing alternativo
2.2.3.1. ex
2.2.3.1.1. troponina T (ratinho)
2.2.3.1.2. H tem menos genes q esperado...
2.3. Classificação ADN
2.3.1. genes codificantes
2.3.1.1. RNA
2.3.1.1.1. genes multicópia
2.3.1.2. proteinas
2.3.1.2.1. cópia única
2.3.1.2.2. famílias génicas
2.3.2. DNA repetido
2.3.2.1. DNA satélite
2.3.2.1.1. alta/ repetido
2.3.2.1.2. seq peq (< 100 pb)
2.3.2.1.3. em tandem
2.3.2.2. disperso
2.3.2.2.1. __
2.3.2.2.2. __
2.4. EXON shuffling
2.4.1. ORIGEM INTRÕES
2.4.1.1. modelo "introns early"
2.4.1.1.1. Ancestral com intrões
2.4.1.1.2. EXON SHUFFLING
2.4.1.2. modelo "introns late"
2.4.1.2.1. Ancestral sem intrões
2.4.1.2.2. tRNA com intrões
2.4.2. Exão <--> domínio (c/ função esp.)
2.4.2.1. ex
2.4.2.1.1. insulina
2.4.2.2. exões --> módulos
2.4.2.3. varios exões podem --> = função
3. Regulação génica em procariotas
3.1. Modelo de Britten e Davidson (1970)
3.1.1. __
3.1.1.1. sequências sensor
3.1.1.2. genes integradores (reguladores)
3.1.1.3. genes estruturais
3.1.1.4. (factores de transcrição)
3.2. Eucariotas sem operões
3.2.1. Maior flexibilidade de regulação