1. GERENCIA ADMINISTRATIVA Y FINANCIERA
1.1. DIRRECION DE CONTRATACION
1.2. DIRECCIÓN DE INFRAESTRUCTURA , BIENES Y SERVICIOS
1.3. DIRECCIÓN FINANCIERA
1.4. DIRECCIÓN DE GESTIÓN DOCUMENTAL
2. CONTRALOR DELEGADO PARA SECTOR DE INCLUSIÓN SOCIAL
2.1. DIRECCIÓN DE VIGILANCIA FISCAL
2.2. DIRECCIÓN ESTUDIOS SECTORIALES
3. CONTRALOR DELEGADO PARA EL SECTOR DE INFRAESTRUCTURA
3.1. CONTRALOR DELEGADO PARA EL COMERCIO Y DESARROLLO REGIONAL
3.1.1. CONTRALOR DELEGADO SECTOR DE JUSTICIA
3.1.1.1. CONTRALOR DELEGADO PARA POBLACIÓN FOCALIZADA
3.1.1.1.1. DIRECCIÓN DE ESTUDIOS DE POLÍTICAS PUBLICAS FOSCALIZADAS
4. CONTRALOR DELEGADO PARA EL SECTOR DE LA INFORMACIÓN Y COMUNICACIONES
4.1. CONTRALOR DELEGADO PARA LA GESTIÓN PUBLICA E INSTITUCIONES FINANCIERAS
4.1.1. CONTRALOR DELEGADO PARA EL MEDIO AMBIENTE
5. CONTRALOR DELEGADO AL SERVICIO DE VIVIENDA Y SERVICIO BASICO
5.1. CONTRALOR DELEGADO PARA EL SECTOR DE DEFENSA Y SEGURIDAD
5.1.1. COMITÉ DE EVALUACIÓN SECTORIAL
5.1.1.1. CONTRALOR DELEGADO PARA EL POS-CONFLICTO
5.1.1.1.1. CONTRALOR DELEGADO PARA EL SECTOR AGROPECUARIO
5.1.1.1.2. CONTRALOR DELEGADO PARA EL SECTOR DE MINAS
5.1.2. GERENCIA DEPARTAMENTAL COLEGIADA
5.1.2.1. GRUPOS DELEGADOS DE VIGILANCIA FISCAL
5.1.2.2. GRUPO DE RESPONSABILIDAD FISCAL
5.1.2.3. GRUPO DE COBRO COACTIVO
5.1.2.4. GRUPO DE PARTICIPACIÓN CIUDADANA
5.1.2.4.1. CONTRALOR DELGADO PARA LA PARTICIPACIÓN CIUDADANA
5.1.2.4.2. DIRECCIÓN Y ATENCIÓN CIUDADANA
5.1.2.4.3. DIRECCIÓN Y PROMOCIÓN DE DESARROLLO DEL CONTROL FISCAL PARTICIPATIVO
5.1.2.4.4. DIRECCIÓN DE SEGUIMIENTO REGIONAL
5.1.2.4.5. DIRECCION DE ESTUDIOS MACROECNOMICOS
5.1.2.4.6. DIRECCIÓN DE CUENTAS Y ESTADÍSTICAS FISCALES
6. MINESTERIO PUBLICO
6.1. INSTITUTO DE ESTUDIOS DEL MINISTERIO PUBLICO
6.2. PROCURADURIA GENERAL DE LA NACION
6.3. DEFENSOR DEL PUEBLO
7. AUDITORIA GENERAL DE LA REPUBLICA
8. CONTRALORIA GENERAL DE LA REPUBLICA
8.1. FONDO BIENESTAR SOCIAL DE LA CONTRALORIA GENERAL DE LA REPUBLICA
9. DESPACHO DEL CONTROLADOR GENERAL DE LA REPÚBLICA
9.1. SECRETARIA PRIVADA
9.2. DIRECCIÓN DE INFORMACIÓN , ANALISIS Y REACCIÓN INMEDIATA
9.2.1. UNIDAD DE INFORMACIÓN
9.2.2. UNIDAD DE ANALISIS DE LA INFORMACION
9.2.3. UNIDAD DE REACCIÓN INMEDIATA
9.2.4. SALA FISCAL Y SANCIONATORIA
9.2.5. OFICIO JURIDICO
9.2.6. OFICINA DE CONTROL INTERNO
9.2.7. OFICINA CONTROL DISCIPLINARIO
9.2.8. OFICINA DE COMUNICACIONES Y PUBLICACIONES
9.2.9. CENTRO DE ESTUDIOS FISCALES
9.2.9.1. COMITÉ ASESOR DEL CENTRO DE ESTUDIO DE FISCALES
9.2.9.2. FONDO CUENTA CAPACITACIÓN Y PUBLICACIONES
9.3. UNIDAD INVESTIGACION ESPECIAL CONTRA LA CORRUPCION
9.4. UNIDAD DE SEGURIDAD Y ASEGURAMIENTO TECNOLÓGICO E INFORMÁTICO
9.5. UNIDAD DE COOPERACIÓN NACIONAL E INTERNACIONAL DE PREVENCIÓN , INVESTIGACIÓN E INCAUTACION DE BIENES
9.6. UNIDAD DE APOYO TÉCNICO AL SISTEMA NACIONAL DEL CONTROL FISCAL - SINACOF
9.7. UNIDAD DE APOYO TÉCNICO AL CONGRESO
10. DESPACHO DEL VICECONTRALOR
10.1. OFICINA DE PLANEACION
10.2. OFICINA DE SISTEMAS E INFORMATICA
10.3. GERENCIA TALENTO HUMANO
10.3.1. DIRECCIÓN DE GESTIÓN DE TALENTO HUMANO
10.3.2. DIRECCIÓN DE CARRERA ADMINISTRATIVA