1. الإدارة العامة للتعليم القرآني
1.1. المدير العام
1.1.1. الأمانة العامة
1.1.1.1. الأرشفة والتوثيق
1.1.1.2. إدارة الشؤون الإدارية
1.1.2. التخطيط والتطوير
1.1.2.1. م. التخطيط
1.1.2.2. م. البحوث
1.1.2.3. م. الجودة
1.1.3. المتابعة والتوجيه
1.1.3.1. م. القرآن الكريم
1.1.3.2. م. تعليم الصلاة
1.1.3.3. م. النشاط المدرسي
1.1.3.4. م.الإشراف التربوي
1.1.3.4.1. منسق شرق
1.1.3.4.2. منسق الوسط
1.1.3.4.3. منسق الغرب
1.1.3.5. م. التعليم الإلكتروني
1.1.3.6. م. التكوين والتدريب
1.1.4. قسم المناهج التربوية
1.1.4.1. المقررات
1.1.4.2. المحتوى الالكتروني
1.1.4.3. الوثائق والوسائط التربوية
1.1.5. الإدارة والتنظيم
1.1.5.1. الموارد البشرية
1.1.5.2. المالية
1.1.5.3. التجهيز
1.1.5.4. الإعلام
2. الإدارة العامة للتعليم القرآني
2.1. المدير العام
2.1.1. الأمانة العامة
2.1.2. المالية
2.1.3. المتابعة والتوجيه
2.1.3.1. م.الإشراف التربوي
2.1.3.1.1. منسق شرق
2.1.3.1.2. منسق الوسط
2.1.3.1.3. منسق الغرب
2.1.3.2. م. التعليم الإلكتروني
2.1.4. المناهج التربوية